Protein–RNA interactions for Protein: P59036

LINC00310, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00310, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00310P59036 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LINC00310P59036 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms