Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCBP4P57723 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCBP4P57723 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCBP4P57723 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCBP4P57723 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCBP4P57723 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCBP4P57723 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCBP4P57723 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCBP4P57723 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCBP4P57723 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCBP4P57723 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCBP4P57723 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCBP4P57723 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCBP4P57723 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCBP4P57723 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCBP4P57723 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCBP4P57723 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCBP4P57723 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PCBP4P57723 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCBP4P57723 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCBP4P57723 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCBP4P57723 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCBP4P57723 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCBP4P57723 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PCBP4P57723 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCBP4P57723 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCBP4P57723 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCBP4P57723 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCBP4P57723 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCBP4P57723 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCBP4P57723 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCBP4P57723 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCBP4P57723 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCBP4P57723 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCBP4P57723 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCBP4P57723 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCBP4P57723 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PCBP4P57723 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCBP4P57723 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCBP4P57723 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCBP4P57723 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCBP4P57723 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCBP4P57723 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCBP4P57723 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCBP4P57723 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCBP4P57723 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCBP4P57723 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCBP4P57723 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCBP4P57723 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCBP4P57723 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCBP4P57723 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PCBP4P57723 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCBP4P57723 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCBP4P57723 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCBP4P57723 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCBP4P57723 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCBP4P57723 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCBP4P57723 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCBP4P57723 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCBP4P57723 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms