Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PCBP3P57721 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCBP3P57721 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.5 ms