Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rp1P56716 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rp1P56716 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rp1P56716 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rp1P56716 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rp1P56716 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rp1P56716 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rp1P56716 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rp1P56716 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rp1P56716 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rp1P56716 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rp1P56716 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Rp1P56716 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rp1P56716 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rp1P56716 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rp1P56716 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rp1P56716 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rp1P56716 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rp1P56716 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rp1P56716 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rp1P56716 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rp1P56716 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rp1P56716 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rp1P56716 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rp1P56716 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rp1P56716 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rp1P56716 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rp1P56716 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rp1P56716 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rp1P56716 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rp1P56716 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rp1P56716 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rp1P56716 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rp1P56716 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rp1P56716 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rp1P56716 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rp1P56716 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rp1P56716 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rp1P56716 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rp1P56716 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rp1P56716 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rp1P56716 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rp1P56716 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rp1P56716 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rp1P56716 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rp1P56716 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rp1P56716 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rp1P56716 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rp1P56716 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rp1P56716 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rp1P56716 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rp1P56716 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rp1P56716 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rp1P56716 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rp1P56716 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rp1P56716 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rp1P56716 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rp1P56716 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rp1P56716 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rp1P56716 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rp1P56716 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rp1P56716 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rp1P56716 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rp1P56716 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rp1P56716 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rp1P56716 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rp1P56716 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rp1P56716 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rp1P56716 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rp1P56716 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rp1P56716 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rp1P56716 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rp1P56716 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rp1P56716 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rp1P56716 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rp1P56716 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rp1P56716 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rp1P56716 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rp1P56716 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rp1P56716 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rp1P56716 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rp1P56716 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rp1P56716 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rp1P56716 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rp1P56716 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rp1P56716 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rp1P56716 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rp1P56716 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rp1P56716 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rp1P56716 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rp1P56716 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rp1P56716 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rp1P56716 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rp1P56716 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rp1P56716 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rp1P56716 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rp1P56716 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rp1P56716 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rp1P56716 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rp1P56716 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms