Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rrp1P56183 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rrp1P56183 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rrp1P56183 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rrp1P56183 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rrp1P56183 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rrp1P56183 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rrp1P56183 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rrp1P56183 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rrp1P56183 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rrp1P56183 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rrp1P56183 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rrp1P56183 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rrp1P56183 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rrp1P56183 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rrp1P56183 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rrp1P56183 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rrp1P56183 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rrp1P56183 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rrp1P56183 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rrp1P56183 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rrp1P56183 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rrp1P56183 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rrp1P56183 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rrp1P56183 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rrp1P56183 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rrp1P56183 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rrp1P56183 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rrp1P56183 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rrp1P56183 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rrp1P56183 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rrp1P56183 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rrp1P56183 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rrp1P56183 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rrp1P56183 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rrp1P56183 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rrp1P56183 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rrp1P56183 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rrp1P56183 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rrp1P56183 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rrp1P56183 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rrp1P56183 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rrp1P56183 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rrp1P56183 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rrp1P56183 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rrp1P56183 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rrp1P56183 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rrp1P56183 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rrp1P56183 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rrp1P56183 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rrp1P56183 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rrp1P56183 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rrp1P56183 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rrp1P56183 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rrp1P56183 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rrp1P56183 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rrp1P56183 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rrp1P56183 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rrp1P56183 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rrp1P56183 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rrp1P56183 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rrp1P56183 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rrp1P56183 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rrp1P56183 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rrp1P56183 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rrp1P56183 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rrp1P56183 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rrp1P56183 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rrp1P56183 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rrp1P56183 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rrp1P56183 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rrp1P56183 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rrp1P56183 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rrp1P56183 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rrp1P56183 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rrp1P56183 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rrp1P56183 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrp1P56183 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrp1P56183 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrp1P56183 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrp1P56183 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrp1P56183 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrp1P56183 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrp1P56183 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrp1P56183 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrp1P56183 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrp1P56183 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrp1P56183 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrp1P56183 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrp1P56183 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrp1P56183 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrp1P56183 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rrp1P56183 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Rrp1P56183 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrp1P56183 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrp1P56183 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrp1P56183 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrp1P56183 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrp1P56183 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrp1P56183 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms