Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
AFDNP55196 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
AFDNP55196 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
AFDNP55196 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
AFDNP55196 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
AFDNP55196 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
AFDNP55196 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
AFDNP55196 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
AFDNP55196 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
AFDNP55196 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
AFDNP55196 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
AFDNP55196 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
AFDNP55196 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
AFDNP55196 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
AFDNP55196 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
AFDNP55196 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
AFDNP55196 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
AFDNP55196 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
AFDNP55196 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
AFDNP55196 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
AFDNP55196 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
AFDNP55196 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
AFDNP55196 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
AFDNP55196 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
AFDNP55196 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
AFDNP55196 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
AFDNP55196 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
AFDNP55196 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
AFDNP55196 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
AFDNP55196 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
AFDNP55196 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
AFDNP55196 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
AFDNP55196 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
AFDNP55196 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
AFDNP55196 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
AFDNP55196 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
AFDNP55196 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
AFDNP55196 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
AFDNP55196 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
AFDNP55196 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
AFDNP55196 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
AFDNP55196 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
AFDNP55196 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
AFDNP55196 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
AFDNP55196 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
AFDNP55196 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
AFDNP55196 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
AFDNP55196 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
AFDNP55196 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
AFDNP55196 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
AFDNP55196 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
AFDNP55196 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
AFDNP55196 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
AFDNP55196 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
AFDNP55196 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
AFDNP55196 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
AFDNP55196 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
AFDNP55196 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
AFDNP55196 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
AFDNP55196 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
AFDNP55196 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
AFDNP55196 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
AFDNP55196 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
AFDNP55196 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
AFDNP55196 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
AFDNP55196 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
AFDNP55196 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
AFDNP55196 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
AFDNP55196 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
AFDNP55196 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
AFDNP55196 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
AFDNP55196 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
AFDNP55196 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
AFDNP55196 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
AFDNP55196 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
AFDNP55196 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
AFDNP55196 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
AFDNP55196 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
AFDNP55196 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
AFDNP55196 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
AFDNP55196 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
AFDNP55196 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
AFDNP55196 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
AFDNP55196 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
AFDNP55196 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
AFDNP55196 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
AFDNP55196 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
AFDNP55196 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
AFDNP55196 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
AFDNP55196 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
AFDNP55196 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
AFDNP55196 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
AFDNP55196 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
AFDNP55196 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
AFDNP55196 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
AFDNP55196 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
AFDNP55196 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
AFDNP55196 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
AFDNP55196 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
AFDNP55196 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms