Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AQP4P55087 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AQP4P55087 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AQP4P55087 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AQP4P55087 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AQP4P55087 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AQP4P55087 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AQP4P55087 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AQP4P55087 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AQP4P55087 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AQP4P55087 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AQP4P55087 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AQP4P55087 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AQP4P55087 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AQP4P55087 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AQP4P55087 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AQP4P55087 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AQP4P55087 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AQP4P55087 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AQP4P55087 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AQP4P55087 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AQP4P55087 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AQP4P55087 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AQP4P55087 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AQP4P55087 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AQP4P55087 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AQP4P55087 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AQP4P55087 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AQP4P55087 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AQP4P55087 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AQP4P55087 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AQP4P55087 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AQP4P55087 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AQP4P55087 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AQP4P55087 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AQP4P55087 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AQP4P55087 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AQP4P55087 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AQP4P55087 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AQP4P55087 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AQP4P55087 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AQP4P55087 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AQP4P55087 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AQP4P55087 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AQP4P55087 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AQP4P55087 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AQP4P55087 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AQP4P55087 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AQP4P55087 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AQP4P55087 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AQP4P55087 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AQP4P55087 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AQP4P55087 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AQP4P55087 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AQP4P55087 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AQP4P55087 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AQP4P55087 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AQP4P55087 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AQP4P55087 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AQP4P55087 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AQP4P55087 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AQP4P55087 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AQP4P55087 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AQP4P55087 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AQP4P55087 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AQP4P55087 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AQP4P55087 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AQP4P55087 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AQP4P55087 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AQP4P55087 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AQP4P55087 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AQP4P55087 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AQP4P55087 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AQP4P55087 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AQP4P55087 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AQP4P55087 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AQP4P55087 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AQP4P55087 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AQP4P55087 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AQP4P55087 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AQP4P55087 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AQP4P55087 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AQP4P55087 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AQP4P55087 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AQP4P55087 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AQP4P55087 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AQP4P55087 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AQP4P55087 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AQP4P55087 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AQP4P55087 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AQP4P55087 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AQP4P55087 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AQP4P55087 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AQP4P55087 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AQP4P55087 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AQP4P55087 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AQP4P55087 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AQP4P55087 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AQP4P55087 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AQP4P55087 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.7 ms