Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATN1P54259 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATN1P54259 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATN1P54259 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATN1P54259 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATN1P54259 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATN1P54259 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ATN1P54259 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ATN1P54259 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATN1P54259 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATN1P54259 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATN1P54259 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATN1P54259 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATN1P54259 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATN1P54259 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATN1P54259 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATN1P54259 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATN1P54259 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATN1P54259 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATN1P54259 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ATN1P54259 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ATN1P54259 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATN1P54259 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATN1P54259 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATN1P54259 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ATN1P54259 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATN1P54259 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATN1P54259 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATN1P54259 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATN1P54259 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATN1P54259 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATN1P54259 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATN1P54259 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATN1P54259 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATN1P54259 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATN1P54259 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATN1P54259 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ATN1P54259 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ATN1P54259 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATN1P54259 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATN1P54259 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATN1P54259 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATN1P54259 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATN1P54259 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATN1P54259 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATN1P54259 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATN1P54259 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATN1P54259 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATN1P54259 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATN1P54259 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATN1P54259 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATN1P54259 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATN1P54259 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATN1P54259 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATN1P54259 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATN1P54259 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATN1P54259 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATN1P54259 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATN1P54259 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATN1P54259 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATN1P54259 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATN1P54259 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATN1P54259 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATN1P54259 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATN1P54259 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
ATN1P54259 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATN1P54259 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATN1P54259 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATN1P54259 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATN1P54259 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATN1P54259 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATN1P54259 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATN1P54259 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATN1P54259 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATN1P54259 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ATN1P54259 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATN1P54259 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATN1P54259 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATN1P54259 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATN1P54259 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATN1P54259 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATN1P54259 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATN1P54259 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATN1P54259 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATN1P54259 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATN1P54259 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATN1P54259 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATN1P54259 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATN1P54259 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATN1P54259 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ATN1P54259 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATN1P54259 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATN1P54259 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATN1P54259 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ATN1P54259 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATN1P54259 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATN1P54259 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ATN1P54259 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
ATN1P54259 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATN1P54259 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms