Protein–RNA interactions for Protein: P53978

HEF3, Elongation factor 3B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEF3P53978 MTR3YGR158C 753 nt8.42□□□□□ -1.06
HEF3P53978 PAC2YER007W 1557 nt8.42□□□□□ -1.06
HEF3P53978 MAS1YLR163C 1389 nt8.4□□□□□ -1.06
HEF3P53978 MCM5YLR274W 2328 nt8.4□□□□□ -1.07
HEF3P53978 RGD2YFL047W 2145 nt8.39□□□□□ -1.07
HEF3P53978 YKL077WYKL077W 1179 nt8.39□□□□□ -1.07
HEF3P53978 YBR241CYBR241C 1467 nt8.38□□□□□ -1.07
HEF3P53978 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.37□□□□□ -1.07
HEF3P53978 SRY1YKL218C 981 nt8.37□□□□□ -1.07
HEF3P53978 YBR113WYBR113W 483 nt8.37□□□□□ -1.07
HEF3P53978 SAL1YNL083W 1485 nt8.37□□□□□ -1.07
HEF3P53978 YSC83YHR017W 1158 nt8.36□□□□□ -1.07
HEF3P53978 ARC35YNR035C 1029 nt8.36□□□□□ -1.07
HEF3P53978 YDL177CYDL177C 513 nt8.35□□□□□ -1.07
HEF3P53978 PMP3YDR276C 168 nt8.35□□□□□ -1.07
HEF3P53978 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt8.35□□□□□ -1.07
HEF3P53978 RDN5-2RDN5-2 119 nt8.35□□□□□ -1.07
HEF3P53978 RDN5-3RDN5-3 119 nt8.35□□□□□ -1.07
HEF3P53978 RDN5-4RDN5-4 119 nt8.35□□□□□ -1.07
HEF3P53978 RDN5-5RDN5-5 119 nt8.35□□□□□ -1.07
HEF3P53978 MRPL23YOR150W 492 nt8.35□□□□□ -1.07
HEF3P53978 RSC4YKR008W 1878 nt8.34□□□□□ -1.07
HEF3P53978 PMA2YPL036W 2844 nt8.34□□□□□ -1.07
HEF3P53978 AIM20YIL158W 615 nt8.34□□□□□ -1.07
HEF3P53978 YMR034CYMR034C 1305 nt8.33□□□□□ -1.08
HEF3P53978 CCT3YJL014W 1605 nt8.33□□□□□ -1.08
HEF3P53978 YHR020WYHR020W 2067 nt8.33□□□□□ -1.08
HEF3P53978 HHY1YEL059W 309 nt8.33□□□□□ -1.08
HEF3P53978 PAC10YGR078C 600 nt8.33□□□□□ -1.08
HEF3P53978 ASF1YJL115W 840 nt8.33□□□□□ -1.08
HEF3P53978 COQ1YBR003W 1422 nt8.32□□□□□ -1.08
HEF3P53978 HEM2YGL040C 1029 nt8.32□□□□□ -1.08
HEF3P53978 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt8.32□□□□□ -1.08
HEF3P53978 TAF9YMR236W 474 nt8.32□□□□□ -1.08
HEF3P53978 IRC11YOR013W 471 nt8.32□□□□□ -1.08
HEF3P53978 STT3YGL022W 2157 nt8.31□□□□□ -1.08
HEF3P53978 MCH2YKL221W 1422 nt8.31□□□□□ -1.08
HEF3P53978 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt8.31□□□□□ -1.08
HEF3P53978 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt8.31□□□□□ -1.08
HEF3P53978 YKL153WYKL153W 510 nt8.31□□□□□ -1.08
HEF3P53978 SWD1YAR003W 1281 nt8.31□□□□□ -1.08
HEF3P53978 YBL112CYBL112C 318 nt8.31□□□□□ -1.08
HEF3P53978 HBN1YCL026C-B 582 nt8.31□□□□□ -1.08
HEF3P53978 PPM2YOL141W 2088 nt8.31□□□□□ -1.08
HEF3P53978 ADE5,7YGL234W 2409 nt8.3□□□□□ -1.08
HEF3P53978 DID2YKR035W-A 615 nt8.3□□□□□ -1.08
HEF3P53978 TOM71YHR117W 1920 nt8.3□□□□□ -1.08
HEF3P53978 CYB2YML054C 1776 nt8.3□□□□□ -1.08
HEF3P53978 FRA1YLL029W 2250 nt8.29□□□□□ -1.08
HEF3P53978 FMO1YHR176W 1299 nt8.29□□□□□ -1.08
HEF3P53978 MRPS18YNL306W 654 nt8.29□□□□□ -1.08
HEF3P53978 TMA46YOR091W 1038 nt8.29□□□□□ -1.08
HEF3P53978 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt8.28□□□□□ -1.08
HEF3P53978 SUF16tG(GCC)C 71 nt8.28□□□□□ -1.08
HEF3P53978 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt8.28□□□□□ -1.08
HEF3P53978 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt8.28□□□□□ -1.08
HEF3P53978 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt8.28□□□□□ -1.08
HEF3P53978 SUF20tG(GCC)F1 71 nt8.28□□□□□ -1.08
HEF3P53978 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt8.28□□□□□ -1.08
HEF3P53978 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt8.28□□□□□ -1.08
HEF3P53978 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt8.28□□□□□ -1.08
HEF3P53978 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt8.28□□□□□ -1.08
HEF3P53978 SUF23tG(GCC)J2 71 nt8.28□□□□□ -1.08
HEF3P53978 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt8.28□□□□□ -1.08
HEF3P53978 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt8.28□□□□□ -1.08
HEF3P53978 SUF17tG(GCC)O2 71 nt8.28□□□□□ -1.08
HEF3P53978 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt8.28□□□□□ -1.08
HEF3P53978 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt8.28□□□□□ -1.08
HEF3P53978 MDH1YKL085W 1005 nt8.28□□□□□ -1.08
HEF3P53978 SCS22YBL091C-A 528 nt8.28□□□□□ -1.08
HEF3P53978 GSH1YJL101C 2037 nt8.28□□□□□ -1.08
HEF3P53978 GPH1YPR160W 2709 nt8.28□□□□□ -1.08
HEF3P53978 SLA2YNL243W 2907 nt8.27□□□□□ -1.09
HEF3P53978 RBS1YDL189W 1374 nt8.27□□□□□ -1.09
HEF3P53978 IMG1YCR046C 510 nt8.27□□□□□ -1.09
HEF3P53978 DYS1YHR068W 1164 nt8.27□□□□□ -1.09
HEF3P53978 YKR045CYKR045C 552 nt8.27□□□□□ -1.09
HEF3P53978 SRF1YDL133W 1314 nt8.27□□□□□ -1.09
HEF3P53978 GPD2YOL059W 1323 nt8.27□□□□□ -1.09
HEF3P53978 NTG1YAL015C 1200 nt8.26□□□□□ -1.09
HEF3P53978 RNH1YMR234W 1047 nt8.26□□□□□ -1.09
HEF3P53978 ATO2YNR002C 849 nt8.26□□□□□ -1.09
HEF3P53978 TAH11YJR046W 1815 nt8.26□□□□□ -1.09
HEF3P53978 PEX31YGR004W 1389 nt8.25□□□□□ -1.09
HEF3P53978 YNR014WYNR014W 639 nt8.25□□□□□ -1.09
HEF3P53978 MIP1YOR330C 3765 nt8.24□□□□□ -1.09
HEF3P53978 GCG1YER163C 699 nt8.24□□□□□ -1.09
HEF3P53978 YRB2YIL063C 984 nt8.24□□□□□ -1.09
HEF3P53978 ATG36YJL185C 882 nt8.24□□□□□ -1.09
HEF3P53978 YMR252CYMR252C 405 nt8.24□□□□□ -1.09
HEF3P53978 NME1NME1 340 nt8.24□□□□□ -1.09
HEF3P53978 OPI7YDR360W 435 nt8.23□□□□□ -1.09
HEF3P53978 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt8.23□□□□□ -1.09
HEF3P53978 YAR064WYAR064W 300 nt8.23□□□□□ -1.09
HEF3P53978 TSR2YLR435W 618 nt8.23□□□□□ -1.09
HEF3P53978 EFM1YHL039W 1758 nt8.22□□□□□ -1.09
HEF3P53978 GNP1YDR508C 1992 nt8.22□□□□□ -1.09
HEF3P53978 SEC23YPR181C 2307 nt8.22□□□□□ -1.09
HEF3P53978 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt8.22□□□□□ -1.09
HEF3P53978 CUE4YML101C 354 nt8.22□□□□□ -1.09
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