Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ACLYP53396 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ACLYP53396 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ACLYP53396 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ACLYP53396 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ACLYP53396 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ACLYP53396 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ACLYP53396 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ACLYP53396 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACLYP53396 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACLYP53396 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACLYP53396 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACLYP53396 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ACLYP53396 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACLYP53396 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACLYP53396 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACLYP53396 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACLYP53396 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ACLYP53396 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACLYP53396 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACLYP53396 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACLYP53396 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACLYP53396 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACLYP53396 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACLYP53396 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ACLYP53396 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ACLYP53396 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ACLYP53396 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ACLYP53396 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ACLYP53396 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ACLYP53396 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACLYP53396 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ACLYP53396 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACLYP53396 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACLYP53396 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACLYP53396 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACLYP53396 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACLYP53396 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ACLYP53396 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ACLYP53396 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ACLYP53396 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ACLYP53396 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ACLYP53396 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ACLYP53396 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ACLYP53396 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ACLYP53396 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ACLYP53396 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ACLYP53396 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ACLYP53396 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ACLYP53396 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ACLYP53396 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACLYP53396 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ACLYP53396 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACLYP53396 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACLYP53396 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACLYP53396 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ACLYP53396 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACLYP53396 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACLYP53396 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ACLYP53396 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ACLYP53396 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ACLYP53396 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ACLYP53396 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ACLYP53396 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ACLYP53396 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ACLYP53396 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ACLYP53396 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACLYP53396 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACLYP53396 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACLYP53396 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ACLYP53396 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ACLYP53396 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ACLYP53396 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ACLYP53396 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ACLYP53396 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACLYP53396 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACLYP53396 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ACLYP53396 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACLYP53396 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACLYP53396 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACLYP53396 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACLYP53396 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ACLYP53396 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ACLYP53396 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ACLYP53396 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ACLYP53396 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACLYP53396 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACLYP53396 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACLYP53396 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACLYP53396 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACLYP53396 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ACLYP53396 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ACLYP53396 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ACLYP53396 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ACLYP53396 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ACLYP53396 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ACLYP53396 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ACLYP53396 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ACLYP53396 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ACLYP53396 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms