Protein–RNA interactions for Protein: P53041

PPP5C, Serine/threonine-protein phosphatase 5, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP5CP53041 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP5CP53041 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP5CP53041 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP5CP53041 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP5CP53041 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP5CP53041 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP5CP53041 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP5CP53041 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP5CP53041 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP5CP53041 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP5CP53041 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP5CP53041 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP5CP53041 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP5CP53041 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP5CP53041 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP5CP53041 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP5CP53041 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP5CP53041 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP5CP53041 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP5CP53041 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP5CP53041 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP5CP53041 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP5CP53041 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP5CP53041 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PPP5CP53041 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP5CP53041 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP5CP53041 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP5CP53041 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP5CP53041 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP5CP53041 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP5CP53041 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP5CP53041 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP5CP53041 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP5CP53041 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP5CP53041 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP5CP53041 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP5CP53041 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP5CP53041 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP5CP53041 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP5CP53041 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP5CP53041 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP5CP53041 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP5CP53041 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP5CP53041 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP5CP53041 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP5CP53041 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP5CP53041 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP5CP53041 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP5CP53041 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP5CP53041 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP5CP53041 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP5CP53041 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP5CP53041 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP5CP53041 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP5CP53041 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP5CP53041 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP5CP53041 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP5CP53041 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP5CP53041 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP5CP53041 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP5CP53041 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP5CP53041 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP5CP53041 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP5CP53041 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP5CP53041 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP5CP53041 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP5CP53041 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP5CP53041 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP5CP53041 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP5CP53041 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP5CP53041 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP5CP53041 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP5CP53041 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP5CP53041 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP5CP53041 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP5CP53041 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP5CP53041 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP5CP53041 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP5CP53041 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP5CP53041 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP5CP53041 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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