Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKX2-5P52952 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKX2-5P52952 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKX2-5P52952 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
NKX2-5P52952 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKX2-5P52952 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKX2-5P52952 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKX2-5P52952 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKX2-5P52952 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKX2-5P52952 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKX2-5P52952 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKX2-5P52952 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKX2-5P52952 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKX2-5P52952 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKX2-5P52952 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKX2-5P52952 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKX2-5P52952 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKX2-5P52952 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NKX2-5P52952 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NKX2-5P52952 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX2-5P52952 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX2-5P52952 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX2-5P52952 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX2-5P52952 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKX2-5P52952 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKX2-5P52952 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKX2-5P52952 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKX2-5P52952 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKX2-5P52952 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX2-5P52952 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX2-5P52952 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX2-5P52952 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX2-5P52952 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX2-5P52952 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX2-5P52952 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX2-5P52952 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKX2-5P52952 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NKX2-5P52952 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NKX2-5P52952 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKX2-5P52952 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKX2-5P52952 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKX2-5P52952 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKX2-5P52952 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKX2-5P52952 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKX2-5P52952 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKX2-5P52952 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKX2-5P52952 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKX2-5P52952 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKX2-5P52952 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKX2-5P52952 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKX2-5P52952 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKX2-5P52952 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKX2-5P52952 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKX2-5P52952 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKX2-5P52952 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKX2-5P52952 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKX2-5P52952 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKX2-5P52952 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKX2-5P52952 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKX2-5P52952 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms