Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNA4P52798 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNA4P52798 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNA4P52798 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNA4P52798 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA4P52798 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA4P52798 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNA4P52798 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNA4P52798 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNA4P52798 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNA4P52798 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNA4P52798 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNA4P52798 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNA4P52798 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNA4P52798 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNA4P52798 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFNA4P52798 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA4P52798 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EFNA4P52798 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms