Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GTF2A2P52657 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GTF2A2P52657 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTF2A2P52657 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GTF2A2P52657 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GTF2A2P52657 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
GTF2A2P52657 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GTF2A2P52657 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GTF2A2P52657 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTF2A2P52657 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
GTF2A2P52657 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTF2A2P52657 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTF2A2P52657 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTF2A2P52657 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTF2A2P52657 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTF2A2P52657 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GTF2A2P52657 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GTF2A2P52657 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
GTF2A2P52657 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
GTF2A2P52657 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
GTF2A2P52657 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GTF2A2P52657 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GTF2A2P52657 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GTF2A2P52657 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF2A2P52657 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF2A2P52657 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF2A2P52657 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF2A2P52657 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF2A2P52657 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF2A2P52657 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF2A2P52657 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF2A2P52657 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF2A2P52657 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF2A2P52657 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF2A2P52657 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF2A2P52657 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF2A2P52657 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GTF2A2P52657 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GTF2A2P52657 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTF2A2P52657 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTF2A2P52657 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTF2A2P52657 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTF2A2P52657 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF2A2P52657 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF2A2P52657 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF2A2P52657 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF2A2P52657 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF2A2P52657 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTF2A2P52657 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTF2A2P52657 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTF2A2P52657 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF2A2P52657 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF2A2P52657 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF2A2P52657 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF2A2P52657 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF2A2P52657 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF2A2P52657 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GTF2A2P52657 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GTF2A2P52657 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTF2A2P52657 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTF2A2P52657 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTF2A2P52657 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF2A2P52657 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF2A2P52657 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF2A2P52657 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF2A2P52657 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF2A2P52657 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF2A2P52657 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF2A2P52657 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF2A2P52657 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GTF2A2P52657 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GTF2A2P52657 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GTF2A2P52657 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
GTF2A2P52657 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GTF2A2P52657 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GTF2A2P52657 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF2A2P52657 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF2A2P52657 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF2A2P52657 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF2A2P52657 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF2A2P52657 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF2A2P52657 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF2A2P52657 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF2A2P52657 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF2A2P52657 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF2A2P52657 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF2A2P52657 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF2A2P52657 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GTF2A2P52657 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
GTF2A2P52657 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTF2A2P52657 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTF2A2P52657 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF2A2P52657 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF2A2P52657 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF2A2P52657 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF2A2P52657 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF2A2P52657 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF2A2P52657 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF2A2P52657 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF2A2P52657 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms