Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr1cP52432 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr1cP52432 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr1cP52432 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr1cP52432 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr1cP52432 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr1cP52432 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr1cP52432 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr1cP52432 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr1cP52432 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr1cP52432 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr1cP52432 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr1cP52432 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Polr1cP52432 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Polr1cP52432 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Polr1cP52432 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Polr1cP52432 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Polr1cP52432 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Polr1cP52432 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Polr1cP52432 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106 ms