Protein–RNA interactions for Protein: P51410

Rpl9, 60S ribosomal protein L9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl9P51410 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpl9P51410 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpl9P51410 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpl9P51410 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpl9P51410 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpl9P51410 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpl9P51410 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpl9P51410 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpl9P51410 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpl9P51410 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpl9P51410 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpl9P51410 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpl9P51410 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpl9P51410 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpl9P51410 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpl9P51410 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpl9P51410 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpl9P51410 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpl9P51410 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpl9P51410 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpl9P51410 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpl9P51410 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpl9P51410 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpl9P51410 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpl9P51410 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpl9P51410 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpl9P51410 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpl9P51410 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpl9P51410 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpl9P51410 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpl9P51410 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpl9P51410 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpl9P51410 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpl9P51410 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpl9P51410 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpl9P51410 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpl9P51410 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpl9P51410 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpl9P51410 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpl9P51410 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpl9P51410 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpl9P51410 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpl9P51410 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpl9P51410 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpl9P51410 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpl9P51410 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl9P51410 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl9P51410 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl9P51410 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpl9P51410 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpl9P51410 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpl9P51410 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl9P51410 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl9P51410 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpl9P51410 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpl9P51410 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpl9P51410 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpl9P51410 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpl9P51410 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpl9P51410 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpl9P51410 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpl9P51410 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpl9P51410 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpl9P51410 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpl9P51410 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpl9P51410 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms