Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE6CP51160 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE6CP51160 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE6CP51160 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE6CP51160 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE6CP51160 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE6CP51160 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE6CP51160 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE6CP51160 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE6CP51160 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE6CP51160 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE6CP51160 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE6CP51160 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE6CP51160 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE6CP51160 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE6CP51160 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE6CP51160 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE6CP51160 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE6CP51160 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE6CP51160 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE6CP51160 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE6CP51160 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE6CP51160 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE6CP51160 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE6CP51160 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE6CP51160 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE6CP51160 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE6CP51160 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE6CP51160 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE6CP51160 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE6CP51160 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE6CP51160 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE6CP51160 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE6CP51160 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE6CP51160 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE6CP51160 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE6CP51160 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE6CP51160 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE6CP51160 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE6CP51160 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE6CP51160 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE6CP51160 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE6CP51160 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE6CP51160 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE6CP51160 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE6CP51160 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE6CP51160 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE6CP51160 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE6CP51160 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE6CP51160 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE6CP51160 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE6CP51160 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE6CP51160 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE6CP51160 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE6CP51160 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE6CP51160 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE6CP51160 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE6CP51160 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE6CP51160 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE6CP51160 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE6CP51160 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE6CP51160 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE6CP51160 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE6CP51160 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE6CP51160 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE6CP51160 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE6CP51160 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE6CP51160 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE6CP51160 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE6CP51160 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE6CP51160 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE6CP51160 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE6CP51160 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE6CP51160 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE6CP51160 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE6CP51160 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE6CP51160 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE6CP51160 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE6CP51160 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE6CP51160 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE6CP51160 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE6CP51160 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE6CP51160 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE6CP51160 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE6CP51160 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE6CP51160 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE6CP51160 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE6CP51160 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE6CP51160 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE6CP51160 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE6CP51160 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE6CP51160 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE6CP51160 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE6CP51160 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE6CP51160 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE6CP51160 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE6CP51160 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE6CP51160 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE6CP51160 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE6CP51160 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms