Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt6aP50446 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt6aP50446 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt6aP50446 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt6aP50446 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt6aP50446 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt6aP50446 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt6aP50446 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt6aP50446 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt6aP50446 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt6aP50446 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt6aP50446 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt6aP50446 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt6aP50446 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt6aP50446 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt6aP50446 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt6aP50446 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt6aP50446 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt6aP50446 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt6aP50446 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt6aP50446 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt6aP50446 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt6aP50446 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt6aP50446 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt6aP50446 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt6aP50446 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt6aP50446 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt6aP50446 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt6aP50446 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt6aP50446 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt6aP50446 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt6aP50446 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt6aP50446 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt6aP50446 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt6aP50446 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt6aP50446 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt6aP50446 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt6aP50446 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt6aP50446 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt6aP50446 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt6aP50446 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt6aP50446 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt6aP50446 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt6aP50446 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt6aP50446 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt6aP50446 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt6aP50446 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt6aP50446 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt6aP50446 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt6aP50446 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt6aP50446 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt6aP50446 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt6aP50446 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt6aP50446 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt6aP50446 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt6aP50446 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt6aP50446 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt6aP50446 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt6aP50446 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt6aP50446 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt6aP50446 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt6aP50446 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt6aP50446 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt6aP50446 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt6aP50446 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt6aP50446 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt6aP50446 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt6aP50446 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms