Protein–RNA interactions for Protein: P50396

Gdi1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdi1P50396 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdi1P50396 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdi1P50396 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdi1P50396 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdi1P50396 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdi1P50396 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdi1P50396 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdi1P50396 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdi1P50396 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdi1P50396 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdi1P50396 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdi1P50396 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdi1P50396 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdi1P50396 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdi1P50396 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdi1P50396 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdi1P50396 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdi1P50396 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdi1P50396 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdi1P50396 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdi1P50396 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdi1P50396 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdi1P50396 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdi1P50396 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdi1P50396 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdi1P50396 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdi1P50396 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdi1P50396 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdi1P50396 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdi1P50396 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdi1P50396 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdi1P50396 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdi1P50396 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdi1P50396 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdi1P50396 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdi1P50396 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdi1P50396 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdi1P50396 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdi1P50396 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gdi1P50396 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gdi1P50396 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gdi1P50396 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdi1P50396 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdi1P50396 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdi1P50396 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdi1P50396 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdi1P50396 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdi1P50396 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdi1P50396 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gdi1P50396 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gdi1P50396 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gdi1P50396 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gdi1P50396 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdi1P50396 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdi1P50396 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdi1P50396 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdi1P50396 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdi1P50396 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdi1P50396 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdi1P50396 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdi1P50396 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdi1P50396 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdi1P50396 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdi1P50396 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdi1P50396 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdi1P50396 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdi1P50396 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdi1P50396 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdi1P50396 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdi1P50396 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdi1P50396 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdi1P50396 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gdi1P50396 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdi1P50396 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdi1P50396 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdi1P50396 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdi1P50396 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdi1P50396 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdi1P50396 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdi1P50396 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdi1P50396 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdi1P50396 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdi1P50396 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdi1P50396 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdi1P50396 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdi1P50396 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdi1P50396 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdi1P50396 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdi1P50396 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdi1P50396 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdi1P50396 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdi1P50396 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdi1P50396 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdi1P50396 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdi1P50396 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdi1P50396 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdi1P50396 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdi1P50396 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Gdi1P50396 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdi1P50396 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms