Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psen1P49769 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psen1P49769 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psen1P49769 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psen1P49769 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psen1P49769 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psen1P49769 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psen1P49769 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psen1P49769 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psen1P49769 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psen1P49769 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psen1P49769 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Psen1P49769 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Psen1P49769 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psen1P49769 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psen1P49769 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psen1P49769 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psen1P49769 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psen1P49769 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psen1P49769 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psen1P49769 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psen1P49769 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psen1P49769 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psen1P49769 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psen1P49769 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psen1P49769 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Psen1P49769 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psen1P49769 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psen1P49769 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psen1P49769 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psen1P49769 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psen1P49769 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psen1P49769 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psen1P49769 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psen1P49769 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psen1P49769 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psen1P49769 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psen1P49769 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Psen1P49769 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psen1P49769 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psen1P49769 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psen1P49769 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psen1P49769 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psen1P49769 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psen1P49769 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psen1P49769 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psen1P49769 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psen1P49769 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psen1P49769 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psen1P49769 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psen1P49769 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psen1P49769 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psen1P49769 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psen1P49769 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psen1P49769 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psen1P49769 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psen1P49769 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psen1P49769 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Psen1P49769 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psen1P49769 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Psen1P49769 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psen1P49769 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psen1P49769 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psen1P49769 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psen1P49769 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psen1P49769 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.8 ms