Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSEN1P49768 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSEN1P49768 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSEN1P49768 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSEN1P49768 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PSEN1P49768 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSEN1P49768 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSEN1P49768 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSEN1P49768 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSEN1P49768 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSEN1P49768 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSEN1P49768 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PSEN1P49768 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSEN1P49768 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSEN1P49768 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSEN1P49768 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSEN1P49768 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PSEN1P49768 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSEN1P49768 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSEN1P49768 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSEN1P49768 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSEN1P49768 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSEN1P49768 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSEN1P49768 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSEN1P49768 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSEN1P49768 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSEN1P49768 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSEN1P49768 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PSEN1P49768 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSEN1P49768 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSEN1P49768 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSEN1P49768 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSEN1P49768 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSEN1P49768 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSEN1P49768 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSEN1P49768 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSEN1P49768 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSEN1P49768 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PSEN1P49768 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PSEN1P49768 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PSEN1P49768 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSEN1P49768 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PSEN1P49768 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PSEN1P49768 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSEN1P49768 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSEN1P49768 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSEN1P49768 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSEN1P49768 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSEN1P49768 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSEN1P49768 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSEN1P49768 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSEN1P49768 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSEN1P49768 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSEN1P49768 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PSEN1P49768 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSEN1P49768 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PSEN1P49768 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSEN1P49768 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSEN1P49768 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSEN1P49768 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSEN1P49768 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSEN1P49768 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PSEN1P49768 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSEN1P49768 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSEN1P49768 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSEN1P49768 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSEN1P49768 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms