Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSNK1EP49674 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSNK1EP49674 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSNK1EP49674 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSNK1EP49674 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CSNK1EP49674 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSNK1EP49674 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSNK1EP49674 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSNK1EP49674 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSNK1EP49674 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSNK1EP49674 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSNK1EP49674 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CSNK1EP49674 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSNK1EP49674 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSNK1EP49674 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSNK1EP49674 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSNK1EP49674 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSNK1EP49674 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSNK1EP49674 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSNK1EP49674 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSNK1EP49674 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSNK1EP49674 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSNK1EP49674 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSNK1EP49674 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSNK1EP49674 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSNK1EP49674 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSNK1EP49674 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CSNK1EP49674 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSNK1EP49674 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CSNK1EP49674 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSNK1EP49674 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSNK1EP49674 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSNK1EP49674 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CSNK1EP49674 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSNK1EP49674 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSNK1EP49674 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSNK1EP49674 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSNK1EP49674 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSNK1EP49674 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSNK1EP49674 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSNK1EP49674 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms