Protein–RNA interactions for Protein: P49006

MARCKSL1, MARCKS-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSL1P49006 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MARCKSL1P49006 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MARCKSL1P49006 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MARCKSL1P49006 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MARCKSL1P49006 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MARCKSL1P49006 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MARCKSL1P49006 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MARCKSL1P49006 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MARCKSL1P49006 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MARCKSL1P49006 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MARCKSL1P49006 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MARCKSL1P49006 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MARCKSL1P49006 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MARCKSL1P49006 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MARCKSL1P49006 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MARCKSL1P49006 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MARCKSL1P49006 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms