Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITPNBP48739 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PITPNBP48739 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITPNBP48739 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITPNBP48739 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITPNBP48739 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITPNBP48739 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITPNBP48739 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITPNBP48739 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PITPNBP48739 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITPNBP48739 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITPNBP48739 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITPNBP48739 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITPNBP48739 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITPNBP48739 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITPNBP48739 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITPNBP48739 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITPNBP48739 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITPNBP48739 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PITPNBP48739 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITPNBP48739 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITPNBP48739 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITPNBP48739 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITPNBP48739 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITPNBP48739 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITPNBP48739 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITPNBP48739 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITPNBP48739 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITPNBP48739 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITPNBP48739 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITPNBP48739 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITPNBP48739 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITPNBP48739 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITPNBP48739 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITPNBP48739 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITPNBP48739 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITPNBP48739 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITPNBP48739 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITPNBP48739 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITPNBP48739 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITPNBP48739 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PITPNBP48739 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PITPNBP48739 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PITPNBP48739 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PITPNBP48739 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PITPNBP48739 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PITPNBP48739 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PITPNBP48739 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PITPNBP48739 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PITPNBP48739 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PITPNBP48739 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PITPNBP48739 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PITPNBP48739 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PITPNBP48739 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PITPNBP48739 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITPNBP48739 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms