Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LmnaP48678 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LmnaP48678 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LmnaP48678 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LmnaP48678 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LmnaP48678 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LmnaP48678 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LmnaP48678 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LmnaP48678 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LmnaP48678 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LmnaP48678 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LmnaP48678 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LmnaP48678 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LmnaP48678 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LmnaP48678 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LmnaP48678 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LmnaP48678 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LmnaP48678 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LmnaP48678 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LmnaP48678 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LmnaP48678 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LmnaP48678 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LmnaP48678 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LmnaP48678 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LmnaP48678 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LmnaP48678 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LmnaP48678 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LmnaP48678 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LmnaP48678 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LmnaP48678 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LmnaP48678 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LmnaP48678 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LmnaP48678 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LmnaP48678 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LmnaP48678 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LmnaP48678 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LmnaP48678 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LmnaP48678 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LmnaP48678 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LmnaP48678 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LmnaP48678 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LmnaP48678 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LmnaP48678 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LmnaP48678 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LmnaP48678 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LmnaP48678 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LmnaP48678 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LmnaP48678 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LmnaP48678 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LmnaP48678 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LmnaP48678 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LmnaP48678 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LmnaP48678 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LmnaP48678 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LmnaP48678 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LmnaP48678 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LmnaP48678 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LmnaP48678 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LmnaP48678 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LmnaP48678 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LmnaP48678 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LmnaP48678 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LmnaP48678 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LmnaP48678 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LmnaP48678 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LmnaP48678 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LmnaP48678 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LmnaP48678 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LmnaP48678 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LmnaP48678 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LmnaP48678 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LmnaP48678 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LmnaP48678 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LmnaP48678 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LmnaP48678 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LmnaP48678 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LmnaP48678 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LmnaP48678 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LmnaP48678 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LmnaP48678 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LmnaP48678 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LmnaP48678 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LmnaP48678 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LmnaP48678 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LmnaP48678 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms