Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT6CP48668 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT6CP48668 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT6CP48668 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT6CP48668 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT6CP48668 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT6CP48668 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT6CP48668 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT6CP48668 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT6CP48668 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT6CP48668 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT6CP48668 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT6CP48668 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT6CP48668 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT6CP48668 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT6CP48668 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT6CP48668 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT6CP48668 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT6CP48668 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT6CP48668 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms