Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARCN1P48444 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARCN1P48444 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARCN1P48444 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARCN1P48444 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARCN1P48444 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARCN1P48444 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARCN1P48444 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARCN1P48444 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARCN1P48444 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARCN1P48444 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARCN1P48444 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARCN1P48444 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARCN1P48444 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARCN1P48444 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ARCN1P48444 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARCN1P48444 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARCN1P48444 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARCN1P48444 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARCN1P48444 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARCN1P48444 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARCN1P48444 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARCN1P48444 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARCN1P48444 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARCN1P48444 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARCN1P48444 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARCN1P48444 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARCN1P48444 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARCN1P48444 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARCN1P48444 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARCN1P48444 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARCN1P48444 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARCN1P48444 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARCN1P48444 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ARCN1P48444 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ARCN1P48444 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARCN1P48444 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ARCN1P48444 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARCN1P48444 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARCN1P48444 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARCN1P48444 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARCN1P48444 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARCN1P48444 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARCN1P48444 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARCN1P48444 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARCN1P48444 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARCN1P48444 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARCN1P48444 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARCN1P48444 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARCN1P48444 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARCN1P48444 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARCN1P48444 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARCN1P48444 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARCN1P48444 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ARCN1P48444 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARCN1P48444 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARCN1P48444 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARCN1P48444 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARCN1P48444 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARCN1P48444 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARCN1P48444 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARCN1P48444 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARCN1P48444 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARCN1P48444 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARCN1P48444 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARCN1P48444 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARCN1P48444 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARCN1P48444 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARCN1P48444 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARCN1P48444 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARCN1P48444 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARCN1P48444 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARCN1P48444 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARCN1P48444 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARCN1P48444 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARCN1P48444 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARCN1P48444 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARCN1P48444 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARCN1P48444 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARCN1P48444 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARCN1P48444 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARCN1P48444 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARCN1P48444 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARCN1P48444 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARCN1P48444 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARCN1P48444 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARCN1P48444 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARCN1P48444 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARCN1P48444 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARCN1P48444 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARCN1P48444 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARCN1P48444 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARCN1P48444 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARCN1P48444 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARCN1P48444 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARCN1P48444 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARCN1P48444 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARCN1P48444 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms