Protein–RNA interactions for Protein: P47911

Rpl6, 60S ribosomal protein L6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl6P47911 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpl6P47911 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpl6P47911 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpl6P47911 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpl6P47911 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpl6P47911 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpl6P47911 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rpl6P47911 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rpl6P47911 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rpl6P47911 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl6P47911 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl6P47911 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl6P47911 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl6P47911 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl6P47911 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl6P47911 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl6P47911 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl6P47911 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpl6P47911 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl6P47911 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl6P47911 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl6P47911 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl6P47911 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl6P47911 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl6P47911 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl6P47911 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl6P47911 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl6P47911 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl6P47911 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl6P47911 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl6P47911 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl6P47911 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl6P47911 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl6P47911 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl6P47911 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl6P47911 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl6P47911 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl6P47911 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl6P47911 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl6P47911 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl6P47911 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl6P47911 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl6P47911 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl6P47911 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl6P47911 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl6P47911 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl6P47911 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl6P47911 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl6P47911 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl6P47911 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl6P47911 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl6P47911 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl6P47911 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl6P47911 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl6P47911 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl6P47911 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl6P47911 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl6P47911 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl6P47911 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl6P47911 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl6P47911 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl6P47911 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl6P47911 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl6P47911 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl6P47911 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl6P47911 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl6P47911 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms