Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nedd4P46935 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Nedd4P46935 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nedd4P46935 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nedd4P46935 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nedd4P46935 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nedd4P46935 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nedd4P46935 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nedd4P46935 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nedd4P46935 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nedd4P46935 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nedd4P46935 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nedd4P46935 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nedd4P46935 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nedd4P46935 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nedd4P46935 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nedd4P46935 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nedd4P46935 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nedd4P46935 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Nedd4P46935 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nedd4P46935 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nedd4P46935 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nedd4P46935 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nedd4P46935 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nedd4P46935 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nedd4P46935 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nedd4P46935 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Nedd4P46935 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nedd4P46935 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nedd4P46935 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nedd4P46935 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nedd4P46935 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nedd4P46935 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nedd4P46935 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Nedd4P46935 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nedd4P46935 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nedd4P46935 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nedd4P46935 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nedd4P46935 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nedd4P46935 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nedd4P46935 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Nedd4P46935 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nedd4P46935 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nedd4P46935 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nedd4P46935 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Nedd4P46935 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nedd4P46935 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nedd4P46935 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nedd4P46935 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nedd4P46935 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nedd4P46935 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nedd4P46935 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nedd4P46935 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nedd4P46935 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nedd4P46935 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nedd4P46935 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nedd4P46935 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Nedd4P46935 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Nedd4P46935 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nedd4P46935 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nedd4P46935 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nedd4P46935 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nedd4P46935 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Nedd4P46935 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Nedd4P46935 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nedd4P46935 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nedd4P46935 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nedd4P46935 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Nedd4P46935 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nedd4P46935 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nedd4P46935 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nedd4P46935 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nedd4P46935 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nedd4P46935 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nedd4P46935 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nedd4P46935 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nedd4P46935 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nedd4P46935 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nedd4P46935 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nedd4P46935 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nedd4P46935 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nedd4P46935 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nedd4P46935 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nedd4P46935 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nedd4P46935 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nedd4P46935 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nedd4P46935 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nedd4P46935 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nedd4P46935 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nedd4P46935 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nedd4P46935 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nedd4P46935 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nedd4P46935 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nedd4P46935 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nedd4P46935 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nedd4P46935 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nedd4P46935 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nedd4P46935 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Nedd4P46935 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nedd4P46935 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms