Protein–RNA interactions for Protein: P46718

Pdcd2, Programmed cell death protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd2P46718 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcd2P46718 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcd2P46718 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdcd2P46718 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdcd2P46718 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd2P46718 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd2P46718 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd2P46718 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd2P46718 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd2P46718 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd2P46718 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd2P46718 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd2P46718 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcd2P46718 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcd2P46718 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd2P46718 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd2P46718 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd2P46718 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcd2P46718 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcd2P46718 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcd2P46718 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcd2P46718 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcd2P46718 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcd2P46718 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcd2P46718 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcd2P46718 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcd2P46718 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcd2P46718 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcd2P46718 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdcd2P46718 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdcd2P46718 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdcd2P46718 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcd2P46718 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcd2P46718 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcd2P46718 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcd2P46718 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcd2P46718 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcd2P46718 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcd2P46718 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcd2P46718 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd2P46718 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd2P46718 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd2P46718 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd2P46718 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd2P46718 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd2P46718 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd2P46718 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd2P46718 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd2P46718 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd2P46718 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd2P46718 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd2P46718 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd2P46718 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd2P46718 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd2P46718 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd2P46718 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd2P46718 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd2P46718 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd2P46718 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd2P46718 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pdcd2P46718 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd2P46718 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd2P46718 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd2P46718 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd2P46718 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd2P46718 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcd2P46718 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcd2P46718 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcd2P46718 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcd2P46718 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcd2P46718 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcd2P46718 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcd2P46718 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcd2P46718 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcd2P46718 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcd2P46718 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcd2P46718 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcd2P46718 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcd2P46718 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcd2P46718 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcd2P46718 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd2P46718 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd2P46718 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd2P46718 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd2P46718 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcd2P46718 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcd2P46718 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcd2P46718 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcd2P46718 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pdcd2P46718 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcd2P46718 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcd2P46718 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcd2P46718 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcd2P46718 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd2P46718 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd2P46718 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd2P46718 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd2P46718 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd2P46718 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd2P46718 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms