Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOP2P46087 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOP2P46087 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOP2P46087 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOP2P46087 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NOP2P46087 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOP2P46087 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOP2P46087 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOP2P46087 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOP2P46087 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOP2P46087 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NOP2P46087 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NOP2P46087 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NOP2P46087 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NOP2P46087 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NOP2P46087 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NOP2P46087 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOP2P46087 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOP2P46087 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOP2P46087 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOP2P46087 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOP2P46087 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NOP2P46087 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NOP2P46087 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NOP2P46087 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NOP2P46087 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NOP2P46087 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NOP2P46087 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NOP2P46087 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NOP2P46087 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NOP2P46087 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NOP2P46087 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NOP2P46087 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NOP2P46087 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOP2P46087 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOP2P46087 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOP2P46087 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOP2P46087 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOP2P46087 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NOP2P46087 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NOP2P46087 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NOP2P46087 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NOP2P46087 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NOP2P46087 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NOP2P46087 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NOP2P46087 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NOP2P46087 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NOP2P46087 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NOP2P46087 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NOP2P46087 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOP2P46087 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOP2P46087 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOP2P46087 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NOP2P46087 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOP2P46087 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOP2P46087 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOP2P46087 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NOP2P46087 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOP2P46087 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOP2P46087 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NOP2P46087 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NOP2P46087 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NOP2P46087 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NOP2P46087 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOP2P46087 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOP2P46087 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOP2P46087 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NOP2P46087 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOP2P46087 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOP2P46087 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOP2P46087 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOP2P46087 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOP2P46087 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOP2P46087 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOP2P46087 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOP2P46087 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOP2P46087 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOP2P46087 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOP2P46087 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOP2P46087 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOP2P46087 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NOP2P46087 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOP2P46087 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOP2P46087 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOP2P46087 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOP2P46087 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOP2P46087 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOP2P46087 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NOP2P46087 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOP2P46087 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOP2P46087 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NOP2P46087 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOP2P46087 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOP2P46087 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOP2P46087 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOP2P46087 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOP2P46087 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOP2P46087 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOP2P46087 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOP2P46087 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms