Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSFMP43897 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSFMP43897 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSFMP43897 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSFMP43897 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSFMP43897 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSFMP43897 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSFMP43897 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSFMP43897 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TSFMP43897 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSFMP43897 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSFMP43897 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSFMP43897 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSFMP43897 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSFMP43897 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSFMP43897 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSFMP43897 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSFMP43897 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSFMP43897 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSFMP43897 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSFMP43897 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSFMP43897 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSFMP43897 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSFMP43897 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSFMP43897 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TSFMP43897 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSFMP43897 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSFMP43897 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSFMP43897 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSFMP43897 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSFMP43897 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSFMP43897 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSFMP43897 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSFMP43897 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSFMP43897 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSFMP43897 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSFMP43897 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSFMP43897 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSFMP43897 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSFMP43897 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSFMP43897 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSFMP43897 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSFMP43897 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSFMP43897 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSFMP43897 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSFMP43897 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSFMP43897 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSFMP43897 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSFMP43897 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSFMP43897 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSFMP43897 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSFMP43897 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSFMP43897 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSFMP43897 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSFMP43897 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSFMP43897 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSFMP43897 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSFMP43897 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSFMP43897 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSFMP43897 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSFMP43897 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSFMP43897 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSFMP43897 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TSFMP43897 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSFMP43897 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSFMP43897 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSFMP43897 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSFMP43897 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSFMP43897 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TSFMP43897 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSFMP43897 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TSFMP43897 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSFMP43897 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSFMP43897 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSFMP43897 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSFMP43897 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSFMP43897 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSFMP43897 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSFMP43897 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSFMP43897 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSFMP43897 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSFMP43897 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSFMP43897 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSFMP43897 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSFMP43897 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TSFMP43897 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSFMP43897 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSFMP43897 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSFMP43897 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSFMP43897 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSFMP43897 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSFMP43897 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSFMP43897 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSFMP43897 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSFMP43897 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSFMP43897 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSFMP43897 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSFMP43897 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSFMP43897 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSFMP43897 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms