Protein–RNA interactions for Protein: P43487

RANBP1, Ran-specific GTPase-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP1P43487 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms