Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
DCCP43146 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
DCCP43146 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC34.93■■■■□ 3.18
DCCP43146 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
DCCP43146 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
DCCP43146 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
DCCP43146 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
DCCP43146 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
DCCP43146 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
DCCP43146 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
DCCP43146 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
DCCP43146 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
DCCP43146 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
DCCP43146 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
DCCP43146 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
DCCP43146 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
DCCP43146 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
DCCP43146 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
DCCP43146 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
DCCP43146 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
DCCP43146 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
DCCP43146 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
DCCP43146 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
DCCP43146 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
DCCP43146 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
DCCP43146 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
DCCP43146 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
DCCP43146 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC34.85■■■■□ 3.17
DCCP43146 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
DCCP43146 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
DCCP43146 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
DCCP43146 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
DCCP43146 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
DCCP43146 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
DCCP43146 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
DCCP43146 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
DCCP43146 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
DCCP43146 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
DCCP43146 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
DCCP43146 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
DCCP43146 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
DCCP43146 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
DCCP43146 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
DCCP43146 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
DCCP43146 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
DCCP43146 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
DCCP43146 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
DCCP43146 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
DCCP43146 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
DCCP43146 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
DCCP43146 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
DCCP43146 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
DCCP43146 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
DCCP43146 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
DCCP43146 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
DCCP43146 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
DCCP43146 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
DCCP43146 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
DCCP43146 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
DCCP43146 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
DCCP43146 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
DCCP43146 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
DCCP43146 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
DCCP43146 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
DCCP43146 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
DCCP43146 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
DCCP43146 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
DCCP43146 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
DCCP43146 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
DCCP43146 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
DCCP43146 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
DCCP43146 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
DCCP43146 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
DCCP43146 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
DCCP43146 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
DCCP43146 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
DCCP43146 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
DCCP43146 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
DCCP43146 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
DCCP43146 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
DCCP43146 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
DCCP43146 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
DCCP43146 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
DCCP43146 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
DCCP43146 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
DCCP43146 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
DCCP43146 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
DCCP43146 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
DCCP43146 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
DCCP43146 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
DCCP43146 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
DCCP43146 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
DCCP43146 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
DCCP43146 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
DCCP43146 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
DCCP43146 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
DCCP43146 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
DCCP43146 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
DCCP43146 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
DCCP43146 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms