Protein–RNA interactions for Protein: P42932

Cct8, T-complex protein 1 subunit theta, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct8P42932 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cct8P42932 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cct8P42932 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cct8P42932 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cct8P42932 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cct8P42932 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cct8P42932 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cct8P42932 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cct8P42932 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cct8P42932 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cct8P42932 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cct8P42932 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cct8P42932 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cct8P42932 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cct8P42932 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cct8P42932 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cct8P42932 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cct8P42932 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cct8P42932 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cct8P42932 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cct8P42932 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cct8P42932 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cct8P42932 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cct8P42932 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cct8P42932 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cct8P42932 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cct8P42932 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cct8P42932 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cct8P42932 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cct8P42932 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cct8P42932 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cct8P42932 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cct8P42932 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cct8P42932 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cct8P42932 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cct8P42932 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cct8P42932 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cct8P42932 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cct8P42932 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cct8P42932 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cct8P42932 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cct8P42932 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cct8P42932 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cct8P42932 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cct8P42932 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cct8P42932 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cct8P42932 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cct8P42932 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cct8P42932 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cct8P42932 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cct8P42932 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cct8P42932 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cct8P42932 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cct8P42932 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cct8P42932 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cct8P42932 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cct8P42932 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cct8P42932 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cct8P42932 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cct8P42932 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cct8P42932 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cct8P42932 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cct8P42932 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cct8P42932 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cct8P42932 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cct8P42932 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cct8P42932 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cct8P42932 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cct8P42932 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cct8P42932 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cct8P42932 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cct8P42932 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cct8P42932 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cct8P42932 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cct8P42932 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cct8P42932 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cct8P42932 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cct8P42932 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cct8P42932 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cct8P42932 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cct8P42932 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cct8P42932 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cct8P42932 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cct8P42932 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cct8P42932 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cct8P42932 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cct8P42932 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cct8P42932 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cct8P42932 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cct8P42932 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cct8P42932 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cct8P42932 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cct8P42932 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cct8P42932 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cct8P42932 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cct8P42932 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cct8P42932 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cct8P42932 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cct8P42932 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cct8P42932 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms