Protein–RNA interactions for Protein: P42771

CDKN2A, Cyclin-dependent kinase inhibitor 2A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AP42771 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2AP42771 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDKN2AP42771 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKN2AP42771 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKN2AP42771 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKN2AP42771 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKN2AP42771 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKN2AP42771 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKN2AP42771 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKN2AP42771 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKN2AP42771 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKN2AP42771 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKN2AP42771 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKN2AP42771 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKN2AP42771 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKN2AP42771 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKN2AP42771 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKN2AP42771 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKN2AP42771 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKN2AP42771 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms