Protein–RNA interactions for Protein: P42703

Lifr, Leukemia inhibitory factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,092 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LifrP42703 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LifrP42703 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LifrP42703 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LifrP42703 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LifrP42703 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LifrP42703 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LifrP42703 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LifrP42703 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LifrP42703 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LifrP42703 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LifrP42703 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LifrP42703 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LifrP42703 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LifrP42703 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LifrP42703 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LifrP42703 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LifrP42703 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LifrP42703 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LifrP42703 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LifrP42703 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LifrP42703 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LifrP42703 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LifrP42703 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LifrP42703 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LifrP42703 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LifrP42703 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LifrP42703 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LifrP42703 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LifrP42703 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LifrP42703 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LifrP42703 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LifrP42703 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LifrP42703 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LifrP42703 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LifrP42703 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LifrP42703 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LifrP42703 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LifrP42703 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LifrP42703 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LifrP42703 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LifrP42703 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LifrP42703 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LifrP42703 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LifrP42703 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LifrP42703 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LifrP42703 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LifrP42703 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LifrP42703 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LifrP42703 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LifrP42703 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LifrP42703 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LifrP42703 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LifrP42703 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LifrP42703 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LifrP42703 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LifrP42703 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LifrP42703 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LifrP42703 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LifrP42703 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LifrP42703 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LifrP42703 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LifrP42703 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LifrP42703 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LifrP42703 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LifrP42703 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LifrP42703 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LifrP42703 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LifrP42703 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LifrP42703 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LifrP42703 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LifrP42703 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LifrP42703 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LifrP42703 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LifrP42703 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LifrP42703 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LifrP42703 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LifrP42703 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LifrP42703 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
LifrP42703 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LifrP42703 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LifrP42703 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LifrP42703 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LifrP42703 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LifrP42703 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LifrP42703 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LifrP42703 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LifrP42703 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LifrP42703 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LifrP42703 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LifrP42703 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LifrP42703 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LifrP42703 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LifrP42703 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LifrP42703 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LifrP42703 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LifrP42703 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LifrP42703 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LifrP42703 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LifrP42703 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LifrP42703 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms