Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.21■■■■■ 4.83
NCAPD3P42695 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC45.2■■■■■ 4.83
NCAPD3P42695 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC45.19■■■■■ 4.82
NCAPD3P42695 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
NCAPD3P42695 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC45.19■■■■■ 4.82
NCAPD3P42695 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC45.18■■■■■ 4.82
NCAPD3P42695 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC45.18■■■■■ 4.82
NCAPD3P42695 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
NCAPD3P42695 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC45.18■■■■■ 4.82
NCAPD3P42695 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC45.18■■■■■ 4.82
NCAPD3P42695 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC45.17■■■■■ 4.82
NCAPD3P42695 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.17■■■■■ 4.82
NCAPD3P42695 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
NCAPD3P42695 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC45.16■■■■■ 4.82
NCAPD3P42695 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC45.16■■■■■ 4.82
NCAPD3P42695 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.15■■■■■ 4.82
NCAPD3P42695 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
NCAPD3P42695 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
NCAPD3P42695 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.14■■■■■ 4.82
NCAPD3P42695 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
NCAPD3P42695 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
NCAPD3P42695 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC45.14■■■■■ 4.82
NCAPD3P42695 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
NCAPD3P42695 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
NCAPD3P42695 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC45.13■■■■■ 4.82
NCAPD3P42695 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC45.12■■■■■ 4.81
NCAPD3P42695 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC45.12■■■■■ 4.81
NCAPD3P42695 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
NCAPD3P42695 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
NCAPD3P42695 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
NCAPD3P42695 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
NCAPD3P42695 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC45.07■■■■■ 4.81
NCAPD3P42695 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC45.06■■■■■ 4.8
NCAPD3P42695 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
NCAPD3P42695 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC45.05■■■■■ 4.8
NCAPD3P42695 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
NCAPD3P42695 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
NCAPD3P42695 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
NCAPD3P42695 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC45.03■■■■■ 4.8
NCAPD3P42695 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC45.02■■■■■ 4.8
NCAPD3P42695 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
NCAPD3P42695 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.01■■■■■ 4.8
NCAPD3P42695 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
NCAPD3P42695 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
NCAPD3P42695 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
NCAPD3P42695 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC44.99■■■■■ 4.79
NCAPD3P42695 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.99■■■■■ 4.79
NCAPD3P42695 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC44.98■■■■■ 4.79
NCAPD3P42695 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC44.98■■■■■ 4.79
NCAPD3P42695 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
NCAPD3P42695 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
NCAPD3P42695 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC44.96■■■■■ 4.79
NCAPD3P42695 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
NCAPD3P42695 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC44.94■■■■■ 4.79
NCAPD3P42695 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC44.94■■■■■ 4.78
NCAPD3P42695 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
NCAPD3P42695 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
NCAPD3P42695 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC44.92■■■■■ 4.78
NCAPD3P42695 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
NCAPD3P42695 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
NCAPD3P42695 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC44.91■■■■■ 4.78
NCAPD3P42695 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.91■■■■■ 4.78
NCAPD3P42695 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC44.91■■■■■ 4.78
NCAPD3P42695 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC44.91■■■■■ 4.78
NCAPD3P42695 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
NCAPD3P42695 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC44.91■■■■■ 4.78
NCAPD3P42695 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC44.91■■■■■ 4.78
NCAPD3P42695 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
NCAPD3P42695 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC44.9■■■■■ 4.78
NCAPD3P42695 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
NCAPD3P42695 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC44.89■■■■■ 4.78
NCAPD3P42695 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
NCAPD3P42695 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.87■■■■■ 4.77
NCAPD3P42695 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC44.86■■■■■ 4.77
NCAPD3P42695 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC44.86■■■■■ 4.77
NCAPD3P42695 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
NCAPD3P42695 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC44.85■■■■■ 4.77
NCAPD3P42695 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.85■■■■■ 4.77
NCAPD3P42695 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
NCAPD3P42695 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
NCAPD3P42695 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
NCAPD3P42695 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
NCAPD3P42695 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.84■■■■■ 4.77
NCAPD3P42695 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC44.84■■■■■ 4.77
NCAPD3P42695 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
NCAPD3P42695 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
NCAPD3P42695 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
NCAPD3P42695 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
NCAPD3P42695 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC44.81■■■■■ 4.76
NCAPD3P42695 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC44.8■■■■■ 4.76
NCAPD3P42695 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC44.79■■■■■ 4.76
NCAPD3P42695 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC44.78■■■■■ 4.76
NCAPD3P42695 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
NCAPD3P42695 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC44.78■■■■■ 4.76
NCAPD3P42695 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC44.77■■■■■ 4.76
NCAPD3P42695 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC44.77■■■■■ 4.76
NCAPD3P42695 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC44.77■■■■■ 4.76
NCAPD3P42695 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
NCAPD3P42695 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
NCAPD3P42695 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms