Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nkx1-2P42580 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nkx1-2P42580 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nkx1-2P42580 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nkx1-2P42580 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nkx1-2P42580 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nkx1-2P42580 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nkx1-2P42580 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nkx1-2P42580 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nkx1-2P42580 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nkx1-2P42580 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Nkx1-2P42580 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nkx1-2P42580 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Nkx1-2P42580 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nkx1-2P42580 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nkx1-2P42580 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Nkx1-2P42580 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nkx1-2P42580 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nkx1-2P42580 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Nkx1-2P42580 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nkx1-2P42580 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nkx1-2P42580 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nkx1-2P42580 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Nkx1-2P42580 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nkx1-2P42580 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nkx1-2P42580 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nkx1-2P42580 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nkx1-2P42580 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nkx1-2P42580 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nkx1-2P42580 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nkx1-2P42580 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nkx1-2P42580 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nkx1-2P42580 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nkx1-2P42580 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Nkx1-2P42580 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nkx1-2P42580 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nkx1-2P42580 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nkx1-2P42580 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nkx1-2P42580 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nkx1-2P42580 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nkx1-2P42580 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nkx1-2P42580 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nkx1-2P42580 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nkx1-2P42580 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nkx1-2P42580 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nkx1-2P42580 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nkx1-2P42580 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nkx1-2P42580 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nkx1-2P42580 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nkx1-2P42580 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nkx1-2P42580 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Nkx1-2P42580 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nkx1-2P42580 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nkx1-2P42580 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nkx1-2P42580 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nkx1-2P42580 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nkx1-2P42580 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nkx1-2P42580 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nkx1-2P42580 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nkx1-2P42580 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nkx1-2P42580 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nkx1-2P42580 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nkx1-2P42580 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nkx1-2P42580 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nkx1-2P42580 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nkx1-2P42580 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nkx1-2P42580 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nkx1-2P42580 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nkx1-2P42580 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nkx1-2P42580 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nkx1-2P42580 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nkx1-2P42580 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nkx1-2P42580 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nkx1-2P42580 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nkx1-2P42580 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nkx1-2P42580 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nkx1-2P42580 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nkx1-2P42580 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nkx1-2P42580 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nkx1-2P42580 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nkx1-2P42580 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nkx1-2P42580 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nkx1-2P42580 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nkx1-2P42580 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nkx1-2P42580 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nkx1-2P42580 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nkx1-2P42580 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nkx1-2P42580 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nkx1-2P42580 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nkx1-2P42580 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nkx1-2P42580 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nkx1-2P42580 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nkx1-2P42580 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nkx1-2P42580 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nkx1-2P42580 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nkx1-2P42580 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nkx1-2P42580 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nkx1-2P42580 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nkx1-2P42580 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nkx1-2P42580 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms