Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC19A1P41440 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC19A1P41440 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC19A1P41440 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC19A1P41440 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC19A1P41440 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC19A1P41440 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC19A1P41440 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC19A1P41440 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC19A1P41440 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC19A1P41440 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC19A1P41440 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC19A1P41440 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC19A1P41440 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC19A1P41440 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC19A1P41440 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC19A1P41440 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC19A1P41440 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC19A1P41440 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC19A1P41440 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC19A1P41440 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC19A1P41440 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC19A1P41440 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC19A1P41440 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC19A1P41440 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC19A1P41440 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC19A1P41440 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC19A1P41440 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC19A1P41440 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC19A1P41440 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC19A1P41440 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC19A1P41440 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC19A1P41440 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC19A1P41440 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC19A1P41440 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC19A1P41440 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC19A1P41440 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC19A1P41440 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC19A1P41440 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC19A1P41440 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC19A1P41440 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC19A1P41440 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC19A1P41440 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC19A1P41440 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC19A1P41440 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC19A1P41440 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC19A1P41440 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC19A1P41440 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC19A1P41440 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC19A1P41440 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC19A1P41440 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC19A1P41440 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC19A1P41440 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC19A1P41440 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC19A1P41440 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC19A1P41440 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC19A1P41440 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC19A1P41440 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC19A1P41440 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC19A1P41440 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC19A1P41440 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC19A1P41440 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC19A1P41440 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC19A1P41440 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC19A1P41440 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC19A1P41440 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms