Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTRLP40313 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTRLP40313 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTRLP40313 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTRLP40313 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTRLP40313 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTRLP40313 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTRLP40313 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTRLP40313 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTRLP40313 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTRLP40313 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTRLP40313 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTRLP40313 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTRLP40313 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTRLP40313 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTRLP40313 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTRLP40313 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTRLP40313 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTRLP40313 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTRLP40313 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTRLP40313 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTRLP40313 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTRLP40313 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTRLP40313 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTRLP40313 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTRLP40313 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTRLP40313 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTRLP40313 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTRLP40313 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTRLP40313 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTRLP40313 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTRLP40313 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTRLP40313 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTRLP40313 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTRLP40313 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTRLP40313 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTRLP40313 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTRLP40313 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTRLP40313 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTRLP40313 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTRLP40313 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTRLP40313 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTRLP40313 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTRLP40313 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTRLP40313 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTRLP40313 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTRLP40313 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTRLP40313 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTRLP40313 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTRLP40313 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTRLP40313 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTRLP40313 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTRLP40313 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTRLP40313 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTRLP40313 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTRLP40313 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTRLP40313 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTRLP40313 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTRLP40313 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTRLP40313 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTRLP40313 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTRLP40313 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTRLP40313 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTRLP40313 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTRLP40313 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTRLP40313 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTRLP40313 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTRLP40313 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTRLP40313 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTRLP40313 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTRLP40313 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTRLP40313 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTRLP40313 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTRLP40313 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTRLP40313 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTRLP40313 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTRLP40313 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTRLP40313 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTRLP40313 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTRLP40313 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTRLP40313 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTRLP40313 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTRLP40313 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTRLP40313 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTRLP40313 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTRLP40313 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTRLP40313 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTRLP40313 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTRLP40313 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTRLP40313 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTRLP40313 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTRLP40313 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTRLP40313 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTRLP40313 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTRLP40313 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTRLP40313 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTRLP40313 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTRLP40313 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTRLP40313 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTRLP40313 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms