Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
THPOP40225 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
THPOP40225 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
THPOP40225 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
THPOP40225 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
THPOP40225 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
THPOP40225 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
THPOP40225 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
THPOP40225 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
THPOP40225 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
THPOP40225 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
THPOP40225 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
THPOP40225 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
THPOP40225 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
THPOP40225 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
THPOP40225 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
THPOP40225 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
THPOP40225 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
THPOP40225 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
THPOP40225 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
THPOP40225 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
THPOP40225 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
THPOP40225 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
THPOP40225 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
THPOP40225 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
THPOP40225 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
THPOP40225 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
THPOP40225 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
THPOP40225 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
THPOP40225 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
THPOP40225 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
THPOP40225 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
THPOP40225 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
THPOP40225 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
THPOP40225 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
THPOP40225 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
THPOP40225 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
THPOP40225 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
THPOP40225 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
THPOP40225 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
THPOP40225 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
THPOP40225 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
THPOP40225 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
THPOP40225 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
THPOP40225 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
THPOP40225 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
THPOP40225 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
THPOP40225 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
THPOP40225 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
THPOP40225 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
THPOP40225 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
THPOP40225 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
THPOP40225 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
THPOP40225 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
THPOP40225 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
THPOP40225 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
THPOP40225 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
THPOP40225 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
THPOP40225 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
THPOP40225 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
THPOP40225 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
THPOP40225 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
THPOP40225 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
THPOP40225 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
THPOP40225 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
THPOP40225 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
THPOP40225 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
THPOP40225 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
THPOP40225 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
THPOP40225 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
THPOP40225 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
THPOP40225 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
THPOP40225 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
THPOP40225 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
THPOP40225 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
THPOP40225 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
THPOP40225 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
THPOP40225 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
THPOP40225 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
THPOP40225 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
THPOP40225 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
THPOP40225 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
THPOP40225 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
THPOP40225 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
THPOP40225 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
THPOP40225 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
THPOP40225 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
THPOP40225 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
THPOP40225 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
THPOP40225 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
THPOP40225 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
THPOP40225 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
THPOP40225 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
THPOP40225 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
THPOP40225 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
THPOP40225 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
THPOP40225 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
THPOP40225 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
THPOP40225 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
THPOP40225 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 238.6 ms