Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Chd1P40201 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Chd1P40201 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Chd1P40201 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Chd1P40201 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Chd1P40201 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Chd1P40201 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Chd1P40201 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Chd1P40201 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC35.88■■■■□ 3.34
Chd1P40201 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Chd1P40201 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Chd1P40201 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Chd1P40201 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Chd1P40201 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Chd1P40201 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Chd1P40201 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Chd1P40201 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Chd1P40201 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Chd1P40201 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Chd1P40201 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Chd1P40201 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Chd1P40201 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Chd1P40201 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Chd1P40201 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Chd1P40201 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Chd1P40201 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Chd1P40201 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Chd1P40201 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Chd1P40201 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Chd1P40201 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Chd1P40201 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Chd1P40201 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Chd1P40201 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Chd1P40201 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Chd1P40201 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Chd1P40201 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Chd1P40201 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Chd1P40201 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Chd1P40201 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Chd1P40201 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
Chd1P40201 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Chd1P40201 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Chd1P40201 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Chd1P40201 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Chd1P40201 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Chd1P40201 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Chd1P40201 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Chd1P40201 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Chd1P40201 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Chd1P40201 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Chd1P40201 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Chd1P40201 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Chd1P40201 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Chd1P40201 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Chd1P40201 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
Chd1P40201 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Chd1P40201 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Chd1P40201 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Chd1P40201 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Chd1P40201 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Chd1P40201 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Chd1P40201 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Chd1P40201 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Chd1P40201 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Chd1P40201 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Chd1P40201 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Chd1P40201 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Chd1P40201 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Chd1P40201 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Chd1P40201 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Chd1P40201 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Chd1P40201 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Chd1P40201 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Chd1P40201 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Chd1P40201 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Chd1P40201 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Chd1P40201 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Chd1P40201 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Chd1P40201 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Chd1P40201 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Chd1P40201 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Chd1P40201 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Chd1P40201 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Chd1P40201 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Chd1P40201 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Chd1P40201 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Chd1P40201 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Chd1P40201 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Chd1P40201 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
Chd1P40201 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Chd1P40201 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Chd1P40201 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Chd1P40201 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.29
Chd1P40201 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Chd1P40201 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Chd1P40201 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Chd1P40201 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Chd1P40201 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Chd1P40201 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Chd1P40201 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms