Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT2P35908 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT2P35908 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT2P35908 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT2P35908 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT2P35908 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT2P35908 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT2P35908 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT2P35908 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KRT2P35908 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KRT2P35908 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT2P35908 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT2P35908 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT2P35908 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT2P35908 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT2P35908 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT2P35908 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT2P35908 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT2P35908 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT2P35908 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT2P35908 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT2P35908 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT2P35908 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT2P35908 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT2P35908 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT2P35908 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT2P35908 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT2P35908 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT2P35908 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT2P35908 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT2P35908 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT2P35908 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT2P35908 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT2P35908 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT2P35908 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT2P35908 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT2P35908 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT2P35908 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT2P35908 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT2P35908 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT2P35908 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT2P35908 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT2P35908 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT2P35908 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT2P35908 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT2P35908 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT2P35908 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT2P35908 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KRT2P35908 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KRT2P35908 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT2P35908 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT2P35908 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT2P35908 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT2P35908 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT2P35908 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT2P35908 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT2P35908 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT2P35908 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT2P35908 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT2P35908 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT2P35908 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT2P35908 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT2P35908 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT2P35908 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT2P35908 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT2P35908 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT2P35908 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT2P35908 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT2P35908 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT2P35908 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT2P35908 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT2P35908 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT2P35908 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT2P35908 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT2P35908 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT2P35908 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT2P35908 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT2P35908 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT2P35908 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT2P35908 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT2P35908 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT2P35908 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT2P35908 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT2P35908 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT2P35908 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT2P35908 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT2P35908 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT2P35908 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT2P35908 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT2P35908 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT2P35908 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT2P35908 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT2P35908 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT2P35908 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT2P35908 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT2P35908 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT2P35908 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT2P35908 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT2P35908 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
KRT2P35908 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms