Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PtprkP35822 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PtprkP35822 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.54
PtprkP35822 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
PtprkP35822 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PtprkP35822 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PtprkP35822 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PtprkP35822 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PtprkP35822 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PtprkP35822 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PtprkP35822 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PtprkP35822 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PtprkP35822 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
PtprkP35822 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PtprkP35822 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PtprkP35822 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
PtprkP35822 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PtprkP35822 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PtprkP35822 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PtprkP35822 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PtprkP35822 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
PtprkP35822 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PtprkP35822 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PtprkP35822 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PtprkP35822 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PtprkP35822 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PtprkP35822 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PtprkP35822 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PtprkP35822 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PtprkP35822 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PtprkP35822 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PtprkP35822 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PtprkP35822 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
PtprkP35822 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
PtprkP35822 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
PtprkP35822 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PtprkP35822 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PtprkP35822 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PtprkP35822 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PtprkP35822 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PtprkP35822 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PtprkP35822 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PtprkP35822 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
PtprkP35822 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PtprkP35822 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
PtprkP35822 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
PtprkP35822 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PtprkP35822 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PtprkP35822 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PtprkP35822 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PtprkP35822 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PtprkP35822 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PtprkP35822 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PtprkP35822 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PtprkP35822 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PtprkP35822 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PtprkP35822 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PtprkP35822 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PtprkP35822 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
PtprkP35822 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PtprkP35822 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PtprkP35822 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PtprkP35822 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
PtprkP35822 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PtprkP35822 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PtprkP35822 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PtprkP35822 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PtprkP35822 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PtprkP35822 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PtprkP35822 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PtprkP35822 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PtprkP35822 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PtprkP35822 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
PtprkP35822 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
PtprkP35822 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
PtprkP35822 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PtprkP35822 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PtprkP35822 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PtprkP35822 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PtprkP35822 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PtprkP35822 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PtprkP35822 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PtprkP35822 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PtprkP35822 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PtprkP35822 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PtprkP35822 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PtprkP35822 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PtprkP35822 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
PtprkP35822 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PtprkP35822 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
PtprkP35822 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PtprkP35822 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PtprkP35822 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PtprkP35822 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PtprkP35822 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PtprkP35822 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PtprkP35822 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PtprkP35822 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PtprkP35822 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PtprkP35822 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms