Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn1P35821 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn1P35821 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn1P35821 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn1P35821 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn1P35821 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn1P35821 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn1P35821 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn1P35821 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn1P35821 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn1P35821 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ptpn1P35821 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn1P35821 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ptpn1P35821 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn1P35821 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn1P35821 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn1P35821 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn1P35821 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn1P35821 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn1P35821 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn1P35821 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn1P35821 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn1P35821 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn1P35821 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn1P35821 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn1P35821 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn1P35821 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn1P35821 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn1P35821 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn1P35821 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpn1P35821 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpn1P35821 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpn1P35821 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn1P35821 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn1P35821 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn1P35821 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn1P35821 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn1P35821 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn1P35821 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn1P35821 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn1P35821 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn1P35821 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn1P35821 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn1P35821 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn1P35821 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn1P35821 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn1P35821 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn1P35821 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn1P35821 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn1P35821 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn1P35821 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpn1P35821 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpn1P35821 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpn1P35821 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpn1P35821 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpn1P35821 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpn1P35821 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpn1P35821 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpn1P35821 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpn1P35821 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpn1P35821 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpn1P35821 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpn1P35821 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn1P35821 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn1P35821 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms