Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXD13P35453 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXD13P35453 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXD13P35453 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXD13P35453 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXD13P35453 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXD13P35453 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXD13P35453 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXD13P35453 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXD13P35453 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXD13P35453 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXD13P35453 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXD13P35453 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXD13P35453 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
HOXD13P35453 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXD13P35453 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXD13P35453 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXD13P35453 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXD13P35453 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXD13P35453 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXD13P35453 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXD13P35453 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXD13P35453 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXD13P35453 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXD13P35453 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXD13P35453 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXD13P35453 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXD13P35453 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXD13P35453 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXD13P35453 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXD13P35453 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXD13P35453 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXD13P35453 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXD13P35453 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXD13P35453 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXD13P35453 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HOXD13P35453 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HOXD13P35453 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXD13P35453 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXD13P35453 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXD13P35453 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXD13P35453 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXD13P35453 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXD13P35453 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXD13P35453 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXD13P35453 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXD13P35453 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXD13P35453 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXD13P35453 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXD13P35453 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXD13P35453 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXD13P35453 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXD13P35453 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXD13P35453 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXD13P35453 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXD13P35453 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXD13P35453 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXD13P35453 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXD13P35453 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXD13P35453 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXD13P35453 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXD13P35453 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXD13P35453 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXD13P35453 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXD13P35453 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXD13P35453 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 256.6 ms