Protein–RNA interactions for Protein: P35343

Cxcr2, C-X-C chemokine receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr2P35343 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cxcr2P35343 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cxcr2P35343 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cxcr2P35343 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cxcr2P35343 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cxcr2P35343 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cxcr2P35343 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cxcr2P35343 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cxcr2P35343 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cxcr2P35343 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cxcr2P35343 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cxcr2P35343 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cxcr2P35343 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cxcr2P35343 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cxcr2P35343 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cxcr2P35343 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cxcr2P35343 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cxcr2P35343 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cxcr2P35343 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cxcr2P35343 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cxcr2P35343 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cxcr2P35343 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cxcr2P35343 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cxcr2P35343 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cxcr2P35343 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cxcr2P35343 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cxcr2P35343 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cxcr2P35343 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cxcr2P35343 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cxcr2P35343 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cxcr2P35343 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cxcr2P35343 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cxcr2P35343 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cxcr2P35343 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cxcr2P35343 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cxcr2P35343 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cxcr2P35343 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cxcr2P35343 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cxcr2P35343 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cxcr2P35343 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cxcr2P35343 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cxcr2P35343 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cxcr2P35343 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cxcr2P35343 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cxcr2P35343 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cxcr2P35343 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cxcr2P35343 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cxcr2P35343 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cxcr2P35343 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cxcr2P35343 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cxcr2P35343 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cxcr2P35343 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cxcr2P35343 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cxcr2P35343 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cxcr2P35343 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cxcr2P35343 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cxcr2P35343 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cxcr2P35343 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cxcr2P35343 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cxcr2P35343 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cxcr2P35343 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cxcr2P35343 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cxcr2P35343 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cxcr2P35343 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cxcr2P35343 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cxcr2P35343 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cxcr2P35343 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cxcr2P35343 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxcr2P35343 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxcr2P35343 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxcr2P35343 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxcr2P35343 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxcr2P35343 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cxcr2P35343 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cxcr2P35343 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cxcr2P35343 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cxcr2P35343 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cxcr2P35343 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cxcr2P35343 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cxcr2P35343 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cxcr2P35343 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cxcr2P35343 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cxcr2P35343 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cxcr2P35343 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cxcr2P35343 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cxcr2P35343 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cxcr2P35343 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cxcr2P35343 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cxcr2P35343 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cxcr2P35343 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cxcr2P35343 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cxcr2P35343 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cxcr2P35343 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cxcr2P35343 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cxcr2P35343 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cxcr2P35343 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cxcr2P35343 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cxcr2P35343 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cxcr2P35343 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cxcr2P35343 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.1 ms