Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NF2P35240 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NF2P35240 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NF2P35240 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
NF2P35240 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NF2P35240 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NF2P35240 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NF2P35240 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NF2P35240 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NF2P35240 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NF2P35240 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NF2P35240 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NF2P35240 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NF2P35240 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NF2P35240 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NF2P35240 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NF2P35240 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NF2P35240 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NF2P35240 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NF2P35240 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NF2P35240 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NF2P35240 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NF2P35240 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NF2P35240 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NF2P35240 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NF2P35240 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NF2P35240 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NF2P35240 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NF2P35240 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NF2P35240 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NF2P35240 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NF2P35240 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NF2P35240 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NF2P35240 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NF2P35240 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NF2P35240 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NF2P35240 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NF2P35240 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NF2P35240 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NF2P35240 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NF2P35240 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NF2P35240 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NF2P35240 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NF2P35240 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NF2P35240 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NF2P35240 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NF2P35240 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NF2P35240 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NF2P35240 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NF2P35240 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NF2P35240 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NF2P35240 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NF2P35240 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NF2P35240 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NF2P35240 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NF2P35240 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NF2P35240 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NF2P35240 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NF2P35240 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NF2P35240 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NF2P35240 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NF2P35240 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NF2P35240 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NF2P35240 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NF2P35240 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NF2P35240 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NF2P35240 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NF2P35240 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NF2P35240 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NF2P35240 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NF2P35240 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NF2P35240 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NF2P35240 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NF2P35240 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NF2P35240 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NF2P35240 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NF2P35240 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NF2P35240 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NF2P35240 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NF2P35240 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NF2P35240 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NF2P35240 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NF2P35240 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NF2P35240 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NF2P35240 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NF2P35240 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NF2P35240 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NF2P35240 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NF2P35240 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NF2P35240 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NF2P35240 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NF2P35240 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NF2P35240 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NF2P35240 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NF2P35240 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NF2P35240 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NF2P35240 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NF2P35240 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NF2P35240 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NF2P35240 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms