Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SsbP32067 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SsbP32067 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SsbP32067 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SsbP32067 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SsbP32067 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SsbP32067 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SsbP32067 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SsbP32067 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SsbP32067 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SsbP32067 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SsbP32067 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SsbP32067 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SsbP32067 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SsbP32067 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SsbP32067 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SsbP32067 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SsbP32067 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SsbP32067 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SsbP32067 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SsbP32067 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SsbP32067 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SsbP32067 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SsbP32067 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SsbP32067 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SsbP32067 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SsbP32067 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SsbP32067 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SsbP32067 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SsbP32067 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SsbP32067 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SsbP32067 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SsbP32067 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SsbP32067 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SsbP32067 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SsbP32067 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SsbP32067 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SsbP32067 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SsbP32067 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SsbP32067 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SsbP32067 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SsbP32067 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SsbP32067 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SsbP32067 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SsbP32067 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SsbP32067 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SsbP32067 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SsbP32067 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SsbP32067 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SsbP32067 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SsbP32067 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SsbP32067 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SsbP32067 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SsbP32067 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SsbP32067 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SsbP32067 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SsbP32067 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SsbP32067 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SsbP32067 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SsbP32067 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SsbP32067 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SsbP32067 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SsbP32067 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SsbP32067 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SsbP32067 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SsbP32067 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SsbP32067 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SsbP32067 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SsbP32067 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SsbP32067 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SsbP32067 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SsbP32067 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SsbP32067 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SsbP32067 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SsbP32067 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SsbP32067 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SsbP32067 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SsbP32067 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SsbP32067 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SsbP32067 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SsbP32067 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SsbP32067 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SsbP32067 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SsbP32067 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SsbP32067 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SsbP32067 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SsbP32067 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SsbP32067 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SsbP32067 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SsbP32067 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SsbP32067 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SsbP32067 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SsbP32067 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SsbP32067 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SsbP32067 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SsbP32067 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SsbP32067 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SsbP32067 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SsbP32067 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SsbP32067 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.8 ms